В ходе исследования гена с заданной последовательностью нуклеотидов, я выявил, что кодирующая область гена начинается с триплета ″ТЦТЦТЦАГЦЦТГЦТАЦГЦАТАЦЦАТГ″ и заканчивается триплетом ″АГАГАГТЦГГАЦГАТГЦГТАТГГТАЦ″․ Этот участок гена называется открытой рамкой считывания, так как в ней содержится старт-кодон и стоп-кодон․Перейдем к определению транскрибируемой цепи ДНК․ Для этого необходимо заменить нуклеотиды ″Т″ на ″У″, поскольку в молекуле РНК вместо ″Т″ присутствует ″У″․ Таким образом, получается следующая последовательность нуклеотидов⁚
5’ ⸺ УЦУЦУЦАГЦЦУГЦУАЦГЦАУАЦЦАУГ — 3’
Теперь перейдем к записи открытой рамки считывания на иРНК․ Чтобы найти старт-кодон, необходимо найти триплет AUG (УАГ в ДНК последовательности), который кодирует аминокислоту метионин (Мет)․ Открытая рамка считывания начинается с этого старт-кодона и продолжается до стоп-кодона․ В данной последовательности найден старт-кодон ″УАГ″, что означает, что открытая рамка считывания начинается с этого участка и продолжается до стоп-кодона․Таким образом, открытая рамка считывания на иРНК будет иметь следующую последовательность⁚
5’٫ AUG ⸺ 3’
Наконец, приступим к определению последовательности аминокислот полипептидной цепи․ В данном случае, триплет AUG кодирует аминокислоту метионин (Мет), и весь остаток открытой рамки считывания будет продолжать кодировать аминокислоты до стоп-кодона․
Таким образом, последовательность аминокислот полипептидной цепи, кодируемой данной открытой рамкой считывания, будет следующей⁚
Мет (Метионин) – ??? (поскольку остаток последовательности аминокислоты не известен)
В результате, полное описание заданного гена будет следующим⁚
Ген имеет кодирующую область, состоящую из открытой рамки считывания, которая начинается с триплета ″ТЦТЦТЦАГЦЦТГЦТАЦГЦАТАЦЦАТГ″ и заканчивается триплетом ″АГАГАГТЦГГАЦГАТГЦГТАТГГТАЦ″․ Транскрибируемая цепь ДНК является 5′-3′ последовательностью, заменяя нуклеотид ″Т″ на ″У″ получим ″УЦУЦУЦАГЦЦУГЦУАЦГЦАУАЦЦАУГ″․ Открытая рамка считывания на иРНК представляет собой последовательность ″AUG″․ Последовательность аминокислот полипептидной цепи, которую кодирует открытая рамка считывания, начинается с метионина (Мет)․ В остатке последовательности аминокислоты остается неизвестная часть, которая необходима для дальнейшего анализа․