Пентапептид Вал-Асп-Глу-Сер-Лиз- является последовательностью из пяти аминокислот, а именно валина (Val), аспарагина (Asp), глутамина (Glu), серина (Ser) и лизина (Lys). Каждая из этих аминокислот имеет свою зарядовую характеристику при различных значениях рН.Заряд аминокислоты зависит от того, находится ли она в кислой, щелочной или нейтральной среде. РН-зависимость заряда аминокислот обусловлена электронными и протонными переносчиками их функциональных групп.При рН 7.0⁚
Валин и серин являются нейтральными аминокислотами, поэтому они не имеют заряда в этой среде. Заряд аспарагина, глутамина и лизина в значительной степени зависит от их pKa (константы диссоциации), которые различаются между собой.
Аспарагин и глутамин при рН 7.0 находятся в депротонированной (отрицательно заряженной) форме, поскольку их pKa меньше этого значения. Это означает, что аспарагин и глутамин имеют отрицательный заряд при рН 7.0.
Лизин при рН 7.0 находится в протонированной (положительно заряженной) форме, поскольку его pKa выше этого значения. Это означает, что лизин имеет положительный заряд при рН 7.0.Таким образом, суммарный заряд пентапептида Вал-Асп-Глу-Сер-Лиз- при рН 7.0 равен сумме зарядов аспарагина, глутамина и лизина. Если они все депротонированы, суммарный заряд будет равен -1 (-1) ( 1) -1.При рН ≪ 7.0⁚
В данной среде аспарагин будет депротонирован, имея отрицательный заряд, а глутамин и лизин будут протонированы, имея положительный заряд. Это означает, что суммарный заряд пентапептида будет равен -1 ( 1) ( 1) 1.При рН ≫ 7.0⁚
В данной среде аспарагин будет депротонирован, имея отрицательный заряд, а глутамин и лизин будут протонированы, имея положительный заряд. Это означает, что суммарный заряд пентапептида будет равен -1 ( 1) ( 1) 1.
Таким образом, суммарный заряд пентапептида Вал-Асп-Глу-Сер-Лиз- в зависимости от рН будет равен -1 при рН 7.0; 1 при рН ≪ 7.0 и 1 при рН ≫ 7.0. Смена рН окружающей среды может влиять на зарядовую характеристику пептидов и белков, что имеет важное значение для их функций и взаимодействий в живых организмах.